“本”— 经气集中的本源部位，在四肢下部 ；
“标”— 经气弥漫的散布部位，在头面胸腹上部。
十二经脉中，末梢与根本，其位置有高下之分，“标”在上而“本”在下。人体头面胸背与四肢比较，其部位有上下之异，前者位置较高。因此，十二经脉中，“标”都在头面胸背等上部，而“本”则在四肢下部。
十二经标本的具体记载见《灵枢·卫气》：“足太阳之本，在跟以上五寸中，标在两络命门，命门者，目也。足少阳之本，在窍阴之是，标在窗笼之前，窗笼者，耳也。足少阴之本，在内踝下上三寸中，标在背俞与舌下两脉也。足厥阴之本，在行间上五寸所，标在背俞也。足阳明之本，在厉兑，标在人迎、颊，挟颃颡也。足太阴之本，在中封前上四寸之中，标在背俞与舌本也。手太阳之本，在外踝之后，标在命门之上一寸也。手少阳之本，在小指次指之间上二寸，标在耳后上角下外眦也。手阳明之本，在肘骨中，上至别阳，标在颜下合钳上也。手太阴之本，在寸口之中，标在腋内动(脉)也。手少阴之本，在锐骨之端，标在背俞也。手心主之本，在掌后两筋之间二寸中，标在腋下三寸也”。
各经对背俞和募穴虽然举得不完全，但可以看出：各阳经都是以头面部之标，而各阴经主要以俞募穴为标；各阴阳经都是以四肢为本。本的部位不像“根”那样专指井穴 ，而是位置有高有低，范围较大；标的部位也不像“结”那样着重是指器官，而是指经气散布较广的部位。
3. 标本理论的应用
又如《灵枢·卫气》在论标本证候治法时说：“凡候此者，下虚则厥，下盛则热，上虚则眩，上盛则热痛。故石(实)者绝而止之，虚则引而起之”。张介宾对此解释说：“此诸经标本上下各有所候，在下为本，本虚则厥，元阳下衰也；下盛则热，邪热在下也；在上为标，上虚则眩，清阳不升也；上盛则热痛，邪火上炽也。石者，实也，绝而止之，谓实者可泻，当决绝其根而止其病也。引而起之，谓虚宜补，当导助其气而振其衰也。”这是标本理论指导虚实证候补虚泻实的不同治法。
标本理论在取穴方面的应用，如《素问·标本病传论》说：“凡刺之方，必别阴阳，前后相应，逆从得施，标本相移。故曰：有其在标而求之于标，有其在本而求之于本，有其在本而求之于标，有其在标而求之于本。故治有取标而得者，有取本而得者，有逆取而得者，有从取而得者。故知逆与从，正行无问，知标本者，万举万当，不知标本，是谓妄行”，说明临床取穴是多种多样的。
近取法：
本部腧穴的应用：
标部腧穴的应用：
胸腹背标部穴：以俞募穴为代表，对诊治胸腹内脏疾病有特殊重要意义。如：
取中府、肺俞、风门、膻中诊治肺的疾病；
取脾俞、食窦、章门、中脘诊治脾胃疾病；
取肾俞，关元、气海、维道诊治肾、肠、胞宫和下焦疾病。
本部、标部穴的配合应用：
以上均为一上一下，一远一近标部与本部腧穴相互配合的具体应用。